Au XXI e siècle, six robots créés par le chercheur spécialisé dans la robotique, le Dr. Light, sont modifiés par le génie du mal, le Dr. Wily, et entreprennent une destruction déchaînée ! Il ne reste qu'un seul robot pouvant arrêter les plans de Wily et rétablir la paix : l'héroïque Megaman.